好奇心旺盛且最喜欢不可思议事物的朝日奈未来在成为初中二年级生的春假与魔法使少女理子相遇在奇迹与魔法的引导下她与理子一起变身为传说中的魔法使「光之美少女」未来牵起真爱的熊布偶毛芙伦与从「波纹智慧书」诞生的妖精小哈的手携手并肩击退了威胁「魔法界」与「无魔法界人类界」两个世界的混沌然而这也意味着与大家的分别数年后未来等人奇迹般地再次相遇并开始在各自的世界走向属于自己的未来未来在无魔法界成为了一名大学生而回到魔法界的理子则在魔法学校担任老师毛芙伦依旧陪伴在未来身旁而小哈则成为了从遥远的地方守望世界的存在然而此时魔法界与无魔法界却迎来了新的灾难……以新灾难的预兆为契机分别数月后再次相会的未来与理子在击退神秘敌人的同时两人也将直面自己的过去与未来用「CureUpRapapa」的魔法咒语再次开始令人兴奋不已的故事