1994年，台湾领导人李登辉在与日本作家对谈期间，公然抛出所谓“身为台湾人的悲哀”，从而发表分裂言论，煽动族群对立与分离意识，导致两岸局势骤然紧张。闵中市国安局长吴声来获知情报后，紧急联络二处处长魏广进，通报内容包含两点：其一，台北已启动最高级别情报关系；其二，魏广进的老朋友处境危险，他会即刻派遣支援，倘若来不及，恐怕需要对方自行应对。此时，魏广进正在香港，带领干警马憩、尹宝山执行任务，而他的老朋友正是台湾军情处第四处副处长蒋在珍。中华四海旅社办公室墙壁藏有监控，蒋在珍察觉异常后秘密撤离，魏广进一行追踪至机场。蒋在珍在洗手间更换衣装，遮掩面容登机，魏广进等人紧随其后，搭乘同一航班，一路飞往境外某岛。台湾军情局，第四处上校组长朱应甲刚到办公室，便得知蒋在珍并未前往欧洲，而是临时变更航线。副局长郑桂平召集会议，部署两条潜伏线路，一条是发展大陆青年，目标涵盖应届高中生、现役士兵以及刚考入国安的大学生；另一条是派遣台湾在编人员赴大陆，渗透至党政军企各部门。电话另一端传来怒斥，对方完全不理郑桂平的部署方案，朱应甲紧急上报蒋在珍失联一事。航班抵达东南亚某国，国安二处干警吴加利伪装成司机，亲自将蒋在珍接上车，驶向海边市场。途中，魏广进察觉身后有不明身份人员跟踪，果断下令截获蒋在珍，换车将其转移至安全屋会面。魏广进准备好蒋在珍惯常饮用的咖啡，提起三年前两人的交集。蒋在珍表示自己已被全面监控，她向魏广进透露三桩要事：第一桩涉及大陆导弹部署，相关情报隐蔽极深，军情局长期试图破解却进展缓慢，但近期可能取得突破。此前蒋在珍曾随朱应甲前往巴塞罗那，上级未说明具体任务，仅确认属于踩点行动，至于针对何种目标尚不明朗，近期哪些掌握导弹核心技术的科研单位将赴德国与西班牙，这是关键线索。紧接着，蒋在珍又提及第二桩事，那就是李登辉的分裂言论给军情局施加了巨大压力，近期赴大陆活动的人员数量将成倍增加。而第三桩最为严峻，台北截获一条直通郑桂平的高级情报，蒋在珍仅看到部分内容，但足以证实闵中国安局内部存在畅通的情报通道，换言之，有人正前往国安系统报到，甚至可能已潜伏在魏广进身边，他最好确认外围三名干警并非台湾方面安插的眼线。会面结束后，魏广进考虑到蒋在珍安危，决定护送她转移至海上安全屋。经劝说，蒋在珍勉强同意，途中却突遭武装拦截追杀。深夜，魏广进带队保护蒋在珍乘船撤离，抵达上海安全屋后，发现急救药品已经失效。魏广进见蒋在珍伤势加重，独自外出采购，临行前反复叮嘱她切勿开灯开门。待魏广进返回，蒋在珍已不见踪影，她改乘飞往澳门，期间未察觉空姐递来的饮用水被动手脚，最终因氰化物中毒导致心脏骤停。同一时间里，香港海域发现一具女尸。蒋在珍一死，朱应甲悬着的心终于落地，他向郑桂平汇报派往大陆的人员已经启动，分批渗透的潜伏人员也即将到位。郑桂平称赞朱应甲处置及时，消除了蒋在珍这一隐患，但为平息内部议论，下令所有与蒋在珍有过接触的人员一律停职接受审查，朱应甲首当其冲被约谈。第一处处长礼卿讯问完朱应甲，又找来情报研究室的赵婉芬。赵婉芬主动替朱应甲申请辞职，希望以自己留下为条件换取朱应甲恢复自由。魏广进反复回想蒋在珍先前的话，对身边几名干警生出疑虑。他来到海边悼念故人，马憩见状感慨特殊职业的宿命便是如此，作为国安人员必须时刻做好牺牲准备。另一边，国安二处干警李凤歌找到宫越，正式通知他被市局录取，要求准时前往报到。