石窑村一夜之间二十余名村民同时中毒，祸端竟源于村童捕捉蟋蟀时，不慎将装有剧毒的竹筒落入井中；此竹筒本是生之姐素素欲用来毒害御医天的药筒，素素在下毒之际，才发觉与弟弟的竹筒互相拿错，只得事败而归，却已酿成大祸。御医天为村民诊治后，确认毒性为失传已久的“血荆子”，无药可解，村民仅剩十天性命，生也是中毒者之一。包拯收到匿名信，信中指称十年前药王秋毒害惠王爷乃是遭人陷害，望包拯代为平反。包拯调阅当年秋的案卷，并向当年告发秋的徒弟天查问，得知秋当年所提炼的稀世灵药“血菘香”实属子虚乌有。生偶然听闻包拯谈及井中竹筒，恳求包拯让他触摸竹筒，竟认出那是姐姐素素之物。包拯深入追查，发现竹筒上的刻花与刚收到的匿名信字迹相同；展昭奉命跟踪素素返家，揭穿其身份原是秋之女，不料黄雀在后，天暗中尾随二人，趁其离开后潜入素素家中盗取“血荆子”毒药，更派祥前往掳走生，可惜打草惊蛇，未能得手。素素向包拯坦白一切，并诉说当年天勾结契丹，杀害惠王，嫁祸于秋，又杀妻盗取“血菘香”，借此医治朝廷权贵而扶摇直上。仅凭素素一面之词，难以定天之罪，据秋留给素素的“药王篇”记载，“血菘香”可使尸体不腐，且服用者体内会留下紫结石。包拯为免打草惊蛇，派展昭暗中查验惠王及花（皆因服用过量“血菘香”而亡）的尸首。另一边，天派祥将盗来的“血荆子”投入多处水井，扩大事态，制造恐慌。果然，花的尸身完好无损，四子将尸首运回府中时竟遭袭击，尸首坠江失踪；展昭独自查验惠王尸首，却因打草惊蛇、触犯国法而被撤职查办。中毒村民增至百余人，素素前去暗算天，反被天以“血荆子”毒针刺中，展昭及时现身救下素素，自己却因闪避不及，身中毒针。村民毒发身亡的期限仅剩五天，六子破案心切，瞒着包拯再次起出惠王尸首，四子更以内功助展昭恢复功力、压制毒性，自己因此中毒亦在所不惜。果然验证得到实情，但六子却被小惠王擒获，押入天牢候审；包拯从验尸官处取得惠王体内的结石及银针，可惜此为六子私下查验所得，难以作为证供。期限只剩三天，包拯推测天可能将“血菘香”藏于八贤王府的仙翁像内，果然不出所料，村民因而获救，叶家冤案也终于有望平反。公堂之上，天百般狡辩，声称自己毫不知情，推脱得一干二净。包拯誓不罢休，在最后两天内，侥幸从江中打捞出花的尸首，更擒获前来行刺的祥，又查验了两位曾被天医治而起死回生、最终寿终正寝的大臣尸首，发现其并未腐朽，遂再次传天到案。一切真相大白，包拯欲治天之罪，但董太师却称若要斩天，须先斩素素。包拯认为素素只是无心之失，罪不至死。然素素不愿令包拯为难，且内心愧疚于自身所为，竟服下“血荆子”求死。天见素素欲与自己同归于尽，心有不甘，竟胁持前来为他求情的妻子玉茹，导致玉茹难产，包拯让素素服下解药“血菘香”助玉茹顺利产子，天亦心生悔意，为儿子取名望善。最终天依法被问斩，而素素及其族人终得沉冤昭雪。