裴愈为病患刘甲开具了药方，但刘甲最终仍不幸离世。刘御医在一旁冷眼旁观，借机讽刺裴愈不愿救治小皇子。郭内侍失去耐心，直接将裴愈移交内谒局处置。裴愈坚信自己的药方无误，然而刘甲的遗体已被火化，他只得请求李佩仪协助寻找刘甲生前使用的碗筷以作验证。萧怀瑾前往内谒局商议事务，发现李佩仪早早歇息，便到门前询问，却听见她咳嗽不断，显然已感染时疾。萧怀瑾连连叩门，李佩仪勉强起身走到门边，因体力不支跌入萧怀瑾怀中，片刻后略显窘迫，匆忙退后返回房内。 两人隔着门板交谈，李佩仪嘱咐萧怀瑾，若自己未能渡过此劫，请他代为照料杜知行晚年；又提及侍女五仁跟随自己多年，有意将其许配给顾凌舟，望萧怀瑾成全此事。萧怀瑾放心不下，转身赶往掖庭局寻求办法。此时掖庭局所有御医皆外出诊病，宫人仅提供了少许柴胡用于退热。萧怀瑾取药返回内谒局，将药放在李佩仪门前，独自到院中占卜祈福。李佩仪悄悄开门取药，见萧怀瑾竟为自己的安危求问天命，心中涌起一阵暖意。 随后几日，裴愈每日上门为李佩仪诊脉开药，李佩仪则主动染病试药，裴愈因而更加尽心诊治。数日后，李佩仪果然痊愈，萧怀瑾却忙于在外调查刘甲死因，无暇过问她的病情。李佩仪康复后，几人一同入宫面圣。她向皇帝说明裴愈为自己治疗时所用方剂与刘甲相同，随后萧怀瑾与裴愈被传召入殿。萧怀瑾经多日查访，得知刘甲早有胃疾，此次试药前并未言明；裴愈诊脉时虽已察觉，但因仅有一名试药者，仍不得不开方，刘甲未能承受药效方才丧命。 既然药方证实有效，皇帝决定以此治疗小皇子。李佩仪感激萧怀瑾曾为自己忧心占卜，但回想亲身试药之举仍感后怕，便叮嘱萧怀瑾务必保重身体、避免感染。萧怀瑾调查期间发现，刘甲是由黄御医选定，且其中掺杂私人恩怨。黄御医不满裴愈被传为神医、在太医署风头过盛，萧怀瑾质问为何选中患胃疾的刘甲，黄御医声称是随机抓阄、未做手脚。萧怀瑾取出一张纸条浸入钒石水中，字迹逐渐显现，但黄御医拒不承认，加之刘甲遗体早已焚化，无从追查。 裴愈前往太医署寻找宋御医，却发现他将头浸在脸盆中，已无气息。李佩仪与萧怀瑾闻讯赶来，裴愈说明宋御医素患眼疾，每夜就寝前皆以药物熏蒸，盆中药液亦无异样。萧怀瑾单独唤裴愈至院中询问，了解他最后一次见到宋御医的时间及近日有无异常。裴愈答道，上次见面是戌时三分，二人简短交谈后有人唤宋御医外出，自己便未多加留意。 仵作前来验尸，见宋御医眼部充血，推断其因劳累突发卒中。黄御医当场指认裴愈害死宋御医，称前夜听见二人争执。裴愈解释自己常与师父争论，但绝不可能为药方之事谋害师父。小皇子日渐康复，苏婕妤为裴愈请功领赏，黄御医见裴愈声望正隆，也顺势为其邀功，只是回到太医署便与刘御医低声私语，扬言让裴愈再得意半月，届时必让他追悔莫及。裴愈恰在隔壁记录药方，无意中听到这番对话。 次日，黄御医惊慌失措地奔至内谒局，声称裴愈欲加害自己，缘由是清晨在床边发现一只断头老鼠，认定此为裴愈的警告。李佩仪与萧怀瑾赶到查看，发现死鼠实为黄鼠狼咬断头颅所致，但黄御医慌乱间已承认自己害死刘甲，此刻欲来内谒局对质，却又改口翻供。黄御医刚离开不久便倒地身亡，恰逢尚衣局内侍夏十三路过，高声惊呼出了人命。 李佩仪与萧怀瑾迅速赶到，见黄御医已气绝身亡。询问夏十三如何发现，他称推车经过时偶然看见。太医署两名医工整日都在附近，被问及是否察觉异样，二人皆答未曾留意。李佩仪与萧怀瑾登上屋顶查看，发现一张随意搁置的犁耙与几块磨盘，推测有人以犁耙撬动磨盘砸中黄御医。刘御医仿佛受惊过度，慌慌张张跑来大喊裴愈迟早会害死所有人。 李佩仪追问缘由，刘御医称黄御医曾替裴愈请功，承诺半月内攻克时疾，若未能达成则裴愈将获罪，而眼下皆知此事绝无可能，故裴愈报复黄御医，只是尚无确凿证据。自获准开方以来，裴愈愈加忙碌。时疾虽在皇子皇妃中有所控制，但宫人因得不到救治仍不断病逝。由于药材珍贵，无法普及使用，裴愈想研制一味平价药材，却始终抽不出时间。