裴愈一心要将阿萤培养成顶尖医师，内侍丞病逝后，他悄悄解剖尸体供阿萤研习，不料被宋御医察觉。阿萤只得独自担下罪责，因损毁尸体乃重罪，宋御医决意将她逐出太医署。裴愈得知后设局害死了宋御医。阿萤知晓裴愈所为后愤慨不已，决意与他断绝往来，却仍忍不住潜入停尸房解剖尸体，可惜因死亡时间过久未能获得有用线索。不久裴愈也染上时疾，再次约见阿萤，恳求她务必寻得新鲜尸体解剖，随即当面自尽。阿萤悲痛欲绝，但仍及时解剖了裴愈的遗体，为太医署留下了珍贵经验。 李佩仪慨叹世道不公，若对女子少些偏见，裴愈也不至于枉害多条性命。阿萤全然认罪，在狱中服下毒药，李佩仪及时赶到以银针催吐救回她。郭内侍前来宣旨，因裴愈对抗时疾有功，皇帝特准阿萤觐见。李佩仪陪同阿萤入宫，阿萤主动供认罪行，请求皇帝赐死，李佩仪从旁求情。韦尚书却认为此前几起命案已致宫中人心浮动，阿萤罪不可赦。萧怀瑾也挺身陈情，指出太医署存在性别歧视，夏十三为替阿萤争取学医之机才铸成大错，且阿萤并未直接行凶。皇帝念其驱逐时疾有功，命郭内侍修订太医署制度，并准许阿萤继承宋御医遗志继续行医济世。阿萤另有一事请旨：将夏十三的遗骨送返故乡。 李佩仪与萧怀瑾护送阿萤抵达万州慈善堂，老师傅见到裴愈遗骨痛心不已。李佩仪与萧怀瑾在门外等候时，忽闻阿萤出事，几人冲入屋内，只见裴愈画像已被取下，阿萤静卧于画像旁，留下一封遗书。阿萤在信中嘱咐，平日笔记存于房中衣柜，请李佩仪取之交予刘御医，以助太医署；裴愈既为自己付出性命，自己愿随他同赴黄泉。李佩仪留下一袋银钱托老师傅安葬阿萤，并请其为裴愈与阿萤重绘一幅画像。 阿萤已逝，于另一世界遇见年少时的裴愈在林中相候——那是二人初识不久，夜间共捕萤火虫时，阿萤提及自己无名，裴愈听闻婆婆于夏日拾得孤女，便为其取名夏萤。李佩仪与萧怀瑾返京途中，感叹阿萤离京原为求死。萧怀瑾问李佩仪是否畏死，李佩仪答称需惜命以查灭门真相，却不知真相大白之日能否保全性命，遂请萧怀瑾陪同前往平恩镇拜访故人。 李佩仪来到舅父伍思坪府邸，见其家中陈设与西京富户颇为相似。李佩仪从未见过六岁的表弟，伍夫人推说幼子体弱不宜见客。用膳时伍思坪备下鲜切鲈鱼，萧怀瑾讶异其竟不知李佩仪喜好。李佩仪解释家中遭难后曾溺水，因而厌食海鲜。伍思坪命人将鲈鱼送至幼子处补身，伍夫人神色却显古怪。萧怀瑾察觉有异，借故衣衫沾水离席更衣，暗中尾随仆人，发现所谓“幼子”竟独居偏院。 李佩仪直言问起当年伍思坪本是太子府红人，为何突然辞官迁居平恩镇。伍思坪猜到她想探问灭门旧事，称端王因连战连败，早现疲态，后来狂症发作亦在预料之中。李佩仪又问及每年上元节所赠新衣为何当年未送，伍思坪坚称早已为她穿上。李佩仪由此更确信事发当日自己就在家中。夜间，借熏香弥漫之际，萧怀瑾对李佩仪说起伍夫人举止可疑，撤下的鲈鱼不许送入“幼子”房中。李佩仪察觉伍思坪说辞与多人雷同，似早有串通。 次日清晨，仆人阿旺送水入房，见伍思坪已死于屋内。询问伍夫人是否听闻动静，侍女称老爷夫人分房多年。李佩仪与萧怀瑾欲入房查案，阿旺阻拦说已报官，且伍思坪伤在下体，女眷不宜直视。李佩仪执意探查，萧怀瑾取黑帕为她蒙眼，并严令若生流言必究其责，阿旺连称不敢。二人进房后，萧怀瑾为李佩仪描述房中布局合于招财风水，伍思坪上身俯卧横梁，下体出血严重。 温与卿领兵赶到，听闻李佩仪在房中，便至大厅等候。温与卿重新勘验，发现贵重物品未失，仆从亦无受伤。萧怀瑾心生疑惑：昨夜雷雨交加，却未闻雷声。李佩仪想起此前曾以熏香驱蚊，遂命阿旺取来伍思坪专用熏香查验。